保国会的成立，使顽固派与维新派的斗争更加激化。顽固派大骂康有为“僭越妄为，非杀头不可”，攻击保国会“保中国不保大清”，“名为保国，势必乱国”。只有光绪帝认为，“会能保国，岂不大善”，所以保国会虽然连遭劾奏，但未被查禁。

百日维新 1898年6月，光绪帝颁布《定国是诏》，决定变法，史称戊戌变法。几天以后，光绪帝召见了康有为，任命他在总理衙门章京上行走，准许专折奏事。光绪帝还委任梁启超办理大学堂和译书局事务，擢（Zhuó）升谭嗣同、刘光第、杨锐、林旭等为军机章京，参预新政，负责起草变法的上谕诏书。从6月11日到9月21日，新政共推行了103天，所以又称“百日维新”。

光绪帝在颐和园勤政殿召见康有为，君臣相谈达两个小时。康有为首先谈了政治形势的危急，他说：“四夷交迫，分割洊（jiàn）至，覆亡无日。”接着康有为指出，洋务运动偏于制炮造船，未计法律制度。他请求光绪帝统筹全局，“先开制度局而变法律”。光绪帝表示赞同。康有为问：“皇上之圣既见及此，何为久而不举，坐致割弱？”光绪帝防人偷听，注视一下窗外，然后叹息说：“奈掣肘何！”康有为意识到这是暗示慈禧太后和守旧大臣，但他仍鼓起勇气，激励光绪帝就权力能够做到的先做，行可变之法，也可以救国。他建议不必尽撤守旧大臣，维持他们的高官厚禄；同时破格提拔有才识的维新志士，由他们办理新政。他认为这样就可以减少变法的阻力。

在百日维新期间，光绪帝颁布了一系列的变法诏书，主要内容有：